Alexander van Loon studeerde aan de Wittenburg University in de VS, aan de Eidgenössische Technische Hochschule (ETH) in Zwitserland en aan de Universiteit Utrecht waar hij in 2005 afstudeerde met een master in de Biomoleculaire Wetenschappen. Hij deed daarbij onderzoekservaring op in het Universitair Medisch Centrum in Utrecht.